Pri vseh kompleksnejših sistemih je potrebno sistem ustrezno konfigurirati. Programska oprema, ki jo dobavi proizvajalec kontrolerja, omogoča učinkovito in enostavno vpisovanje kartic, uporabnikov, določanje urnikov dostopa, omejitve posameznih uporabnikov, izpise dogodkov in tekoče spremljanje in intervencije nad sistemom. Pomembni kriteriji, ki jih je potrebno upoštevati: število uporabnikov, maksimalno število kontrolerjev, ki jih lahko krmilimo, maksimalno število čitalcev, število nadzorovanih vhodov, koliko ključavnic lahko krmilimo, nadzorovani izhodi, število urnikov, definicija praznikov... Za ustreznost izbire vam priporočamo, da naročite demonstracijsko verzijo, ki vam bo v veliko pomoč pri odločitvi.